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趋势分析自动化

Yao Shuliang / 2019-02-21


趋势分析的两大类:

对于趋势分析报告来说,同时也可以基于第2条,因为一个方便的获取趋势分析图形的途径,能让我们更快速的完成报告。

想象一下以下场景:
不断的点点点……呀,出来一张趋势图,copy, paste。然后 继续点点点……呀,又出来一张趋势图,copy, paste。然后……
咦?有张图做错了,重新点点点……呀,出来了,copy, paste……
呼,终于弄完了……

这里,一方面,我们只能靠手工去生成图形,另一方面,手工操作容易犯错,第三方面,错了以后纠正的时间和操作成本高。

就像这篇文章里提到的一样,“all result from data should be reproducible”。这里一方面是指结果要容易重现,另一方面是指结果要可以重现。(当你面对一个结果的时候,鬼知道做这个结果的人都做了什么具体的操作)

本文章的目的:

所以,本文就着重在两个方面来讲:

GMP关于年度产品质量回顾的要求

根据GMP第八节,应当按照操作规程,每年对所有生产的药品按品种进行产品质量回顾分析,以确认工艺稳定可靠,以及原辅料、成品现行质量标准的适用性,及时发现不良趋势,确定产品及工艺改进的方向。应当考虑以往回顾分析的历史数据,还应当对产品质量回顾分析的有效性进行自检。

根据GMP要求,我们每年都会做年度产品质量回顾,同时,趋势分析也是其中比较重要的一个方面,但是在这个过程中往往遇到的比较多的问题:

往往这时,我是我们最为苦恼的时候。

解决办法

有没有什么解决办法呢?有!那就是趋势分析自动化:

下面我们来展示几种软件的趋势分析自动化的示例。

示例数据

本贴所有数据均使用此数据:

点此下载

R语言:Utility Trend Analysis Application

我开发了一个基于R语言的数据分析电子系统,它是一个网页应用。目前没有帐号控制,但是大家可以作为非GMP用途用作日常查看趋势图。总的来说还是非常方便的。

地址:http://apps.drugqm.com:3838/sample-apps/Trend_Automation/

分析数据范围:公用工程系统数据,包括总需氧菌,电导,TOC

使用介绍:

趋势分析自动化

  1. 首先打开网址,如图,点击OK或弹出窗口外部区域,即可关闭弹出窗口:

  1. 然后点击顶部导航栏的Water-WFO 或者 Water-PW,这里点击Water-PW。点击Browse上传文件(上面的示例文件或者自己的数据按示例文件整理。注意如果使用本电子系统,示例文件的工作薄名和列名不能修改,内容可以修改。),然后选择日期范围,点击Apply。右侧即显示图形。

如果想不显示所有点,只想显示其中一部分,则点击Individual,然后下面会出现一个文本框,点击一下,则可以选择数据中包含的点。确认日期范围,所有筛选均选择完后,点击Apply。图形则会自动更新。

如果想看图中某些点的采样日期取样点名称测试结果等信息,则可直接在图上拖选需要查看的点,数据会在页面最下方显示。

到这里,趋势分析自动化就结束了,下面来看一下报告的自动生成。

报告自动生成。

所有条件设置完成后,点击Open/Close Report Mode下方,选中Yes,则每个图形上下方均会出现一个文本框,填入相应的内容。然后选择Document FormatWORD,然后点击Download,直接保存或打开下载的文档。

我们可以看到,图和描述自动生成了一个Word文档。

最有意思的是,如果你发现内容填错了,或者日期范围错了,或者点选错了等等,只需要回去重新设置一下,点击Apply,然后再下载一下报告,则内容会自动更新。

JMP

如果我们的数据存在Excel文件里,我们可以选择“文件->新建->脚本”,把下面脚本粘过去,脚本如下:

dt1 = Open(
“D:\Data Demo.xlsx”, //文件路径 Worksheets( “WFO-Data-Input” ), //工作薄名称 columns(
New Column( “A含量”, Numeric, “Continuous”, Format( “Best”, 12 ) )
),
Import Settings(
End Of Line( CRLF, CR, LF ),
End Of Field( Comma, CSV( 1 ) ),
Strip Quotes( 0 ),
Use Apostrophe as Quotation Mark( 0 ),
Use Regional Settings( 0 ),
Scan Whole File( 1 ),
Treat empty columns as numeric( 0 ),
CompressNumericColumns( 0 ),
CompressCharacterColumns( 0 ),
CompressAllowListCheck( 0 ),
Labels( 1 ),
Column Names Start( 1 ),
Data Starts( 2 ),
Lines To Read( “All” ),
Year Rule( “20xx” )
)
);

如果我们的数据存在Excel文件里,我们可以选择“文件->新建->脚本”,把下面脚本粘过去,脚本如下:

dt2 = open(“D:\WFO-Data-Input.jmp”);

点击运行,JMP就会打开一个数据窗口,并把数据读进来了。

注意,此时脚本窗口先别关。

然后我们手工去做图。比如,我做了一个时间序列图,得到如下图:

点击窗口左上角的小红图标->保存脚本->至数据表,我们会发现数据表里多了一个名字,右键单击,选择编辑,则发现,这是JMP里做图的一段脚本,复制到上面打开文件的脚本后面,成品如下:

dt2 = open(“D:\WFO-Data-Input.jmp”);
Overlay Plot( Y( :Result ), Separate Axes( 1 ) ,Connect Thru Missing( 1 ))

好,现在保存这个脚本,存下来。

下次我们直接打开这个脚本,运行即可,或者打开JMP,在脚本文件上右击,点击运行。就自动出图了。

Minitab

Minitab绘图也是比较方便的,我们来介绍一下。

和其它软件一样,Minitab有多种数据导入方式,而其中比较方便的一个,就是菜单中的”编辑->工作表链接->管理链接”,它可以动态读取Excel中的数据,并且,在图形上右键单击,勾选“自动更新图形”后,只要excel数据填了新数据,它会自动更新,让我们来看一下怎么设置吧。

选择”编辑->工作表链接->管理链接”,出现如下窗口

点击“添加”,然后按图示和根据实际,填写相关信息

确定,数据自动导入到工作表中,绘制图形,在图形上右键单击,勾选“自动更新图形”

Excel更新,Minitab中的图会自动更新

目前Minitab支持的软件有Excel, SPSS, Access。

注意Minitab和JMP,可以使用自身的工作表存储数据,不必一定要存在excel中。

对于Minitab来说,可以用其自身存储数据,然后存成.MPJ文件,即一个Minitab Project文件。则以后图形和数据表就都存在这个文件中了。